产品介绍
由国家海产品科学实验实验院微科研机构应用实验中间李炯棠实验团对合力与南京康普森林果科技有限的厂家开发设计一个多款适用于鲤研发、产品种类评定等最好适用范围的表观遗传研发基带集成块
——“鲤育1号”(图2)。该基带集成块分为了20K个高质量量高的的SNP位点,为小鲫鱼流通业提质增强药效,研发高质量、超高产、耐粗、高抗、耐密等高品质相对性状的小鲫鱼优种展示有效的科技应用支撑点。
“鲤育壹号”主要还包括康普森CAGT(®)靶点驯服测序高技术,具有16种主养鲫鱼的全DNA组重测序变种和很重要的第三产业物理性质绑定标示。“鲤育壹号”IC处理集成电路集成块位点复盖全DNA组选取生物选育调节作用大的位点和包涵好几种鲫鱼社会群体多态性标示。该IC处理集成电路集成块具有鲫鱼有营养品质保证物理性质(粗淀粉酶、粗蛋白质多、酪氨酸、蛋白质多酸、胸肌质构、肌间刺、纹段等)、静脉血化学成分及分量、两性等物理性质的大分子标示18056个,另外还还包括辨认16种鲤平种特情人位点144个,可以选择于很重要的物理性质的生物选育值确定和平种确权确保。进行范例IC处理集成电路集成块检查,“鲤育壹号”IC处理集成电路集成块,服务位点检测率高,月均检测率提高了95.18%,服务不稳相关性性好、DNA型明确高,多个范例月均分析同步比率98.77%,服务功能发芽势。
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品牌数据信息
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重点参数值
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“鲤育壹号”选育集成电路芯片
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标志资讯
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标上结构类型
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SNP
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标签平均
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20359
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鲤鱼营养品质性状、血液成分及含量、 性别等性状功能位点
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18056
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新品种评定位点
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144
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工艺方式
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康普森CAGT®靶向治疗抓取测序技艺
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考生基因组组
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GCF_018340385.1
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数据表现
“鲤育一号”— 染色体分布情况
鲤鱼(Cyprinus carpio)作为异源四倍体鱼类,各由25条染色体组成。该芯片囊括了A亚基因组和B亚基因组的鲤亚基因组水平的变异,为在四倍体背景下开展重要经济性状遗传解析,进行基因组选择育种技术创新提供了新的视野。
图1 芯片位点在染色体上(A基因组和B基因组)的分布图
“鲤育一号”育种芯片 — MAF分布
图2 芯片位点MAF分布
“鲤育一号”育种芯片 — 位点注释情况
图3 芯片位点注释情况
“鲤育一号”育种芯片 — 分型一致性
图4 重复样本分型一致性
通过对3组重复样本进行分型,显示平均一致率达98.77%。
以上结果表明,鲤育一号位点选择合理、变异丰富、一芯多用(育种、品种鉴定、功能位点因果检测),芯片设计出众,分型结果表现优异,能够满足大量样本的检测需求。