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基因组重测序
低深度重测序
低深度重测序
简要概述
全表观隔代遗传什么是表观隔代遗传隔代遗传组低进一步重测序（Low coverage WGS，LcWGS）指的是根据较低进一步（~1×）的重测序参数文件对其进行隔代遗传什么是表观隔代遗传隔代遗传隔代遗传什么是表观隔代遗传进化隔代遗传什么是表观隔代遗传分型，以后经由表观隔代遗传什么是表观隔代遗传隔代遗传型填冲，将低硬度参数文件填冲为高硬度表观隔代遗传什么是表观隔代遗传隔代遗传型参数文件。LcWGS 不需操作系统开发建设，测序总效率高，会获利全表观隔代遗传什么是表观隔代遗传隔代遗传组隔代遗传什么是表观隔代遗传隔代遗传隔代遗传什么是表观隔代遗传进化，更有好处于大大小样版的物理性质定位系统及 GS 生物育种应运。
应用场景
01. 性状定位
动植物全基因组关联分析
02. 遗传评估
动植物全基因组选择育种
技术优势
  • 变异信息
    丰富
    可提升全人类基因组的遗传病进化
  • 高性价比
    以超低的测序费用低，提升高比热容的标志，测试利用率高
  • 大群体
    样本检测
    实主要用于大受众群体的dna型测量及探究
  • 分型
    准确性高
    源于添充神经网络算法，临床诊断准确的率达到98%
技术流程
优秀案例
低深度重测序--猪胴体分割性状及形态性状的遗传解析与基因组预测
本研究测定了长白、大白、长大二元以及杜长大三元猪4个群体的2,012头猪的17个分割肉性状和14个胴体性状。使用单倍型GWAS分析和基于基因型填充数据的GWAS分析分别鉴定到14个和112个与胴体分割性状极显著相关的QTLs。利用“中芯一号”芯片检测数据和基因型填充数据对这四个不同群体的分割肉性状和胴体性状进行全基因组选择研究。比较不同基因型数据、不同群体、以及不同预测模型对基因组预测准确性的影响。
图1 GWAS相对性状产品定位及GS最终相对
参考文献
Xie, L., Qin, J., Rao, L., Cui, D., Tang, X., Chen, L., Xiao, S., Zhang, Z., & Huang, L. (2023). Genetic dissection and genomic prediction for pork cuts and carcass morphology traits in pig. Journal of animal science and biotechnology, 14(1), 116.
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