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基因组重测序
低深度重测序
低深度重测序
简要概述
全表观隐性什么是基因组隐性基因组低宽度重测序（Low coverage WGS，LcWGS）指的是开始较低宽度（~1×）的重测序大数据库统计开始隐性什么是基因组隐性基因变种分几型，在此之后确认表观隐性什么是基因组隐性基因型补充，将比热容低计算大数据库统计补充为高比热容计算表观隐性什么是基因组隐性基因型大数据库统计。LcWGS 不能自己模式搭建，测序利润低，也可以读取全表观隐性什么是基因组隐性基因组隐性什么是基因组隐性基因变种，更有助于于大经营规模模本的物理性质分析及 GS 繁育广泛应用。
应用场景
01. 性状定位
动植物全基因组关联分析
02. 遗传评估
动植物全基因组选择育种
技术优势
  • 变异信息
    丰富
    可刷出全染色体组的遗传病进化
  • 高性价比
    以较低的测序利润低，赢得高规格的标签，检验生产率高
  • 大群体
    样本检测
    可用来大客户群体的遗传基因型论文检测及探讨
  • 分型
    准确性高
    为放置数学模型，分几型最准确度可达到98%
技术流程
优秀案例
低深度重测序--猪胴体分割性状及形态性状的遗传解析与基因组预测
本研究测定了长白、大白、长大二元以及杜长大三元猪4个群体的2,012头猪的17个分割肉性状和14个胴体性状。使用单倍型GWAS分析和基于基因型填充数据的GWAS分析分别鉴定到14个和112个与胴体分割性状极显著相关的QTLs。利用“中芯一号”芯片检测数据和基因型填充数据对这四个不同群体的分割肉性状和胴体性状进行全基因组选择研究。比较不同基因型数据、不同群体、以及不同预测模型对基因组预测准确性的影响。
图1 GWAS物理性质标记及GS导致比
参考文献
Xie, L., Qin, J., Rao, L., Cui, D., Tang, X., Chen, L., Xiao, S., Zhang, Z., & Huang, L. (2023). Genetic dissection and genomic prediction for pork cuts and carcass morphology traits in pig. Journal of animal science and biotechnology, 14(1), 116.
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