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基因组重测序
低深度重测序
低深度重测序
简要概述
全表观基因遗传规律性组低角度1重测序（Low coverage WGS，LcWGS）指的是灵活运用较低角度1（~1×）的重测序动态数据资料分析完成基因遗传规律性变种分析，后续按照表观基因遗传规律性型填色，将低密计算公式动态数据资料分析填色为高体积计算公式表观基因遗传规律性型动态数据资料分析。LcWGS 不要系统软件制作，测序成本价低，可能得到全表观基因遗传规律性组基因遗传规律性变种，更有助于大占比样品的特性定位手机及 GS 制种广泛应用。
应用场景
01. 性状定位
动植物全基因组关联分析
02. 遗传评估
动植物全基因组选择育种
技术优势
  • 变异信息
    丰富
    可换取全基因基因遗传规律组的基因遗传规律进化
  • 高性价比
    以不高的测序总成本以及消耗低，兑换致密单位的标签，查测效应高
  • 大群体
    样本检测
    适于于大社会群体的染色体型查重及探究
  • 分型
    准确性高
    针对添加神经网络算法，基因分型精确性率高达98%
技术流程
优秀案例
低深度重测序--猪胴体分割性状及形态性状的遗传解析与基因组预测
本研究测定了长白、大白、长大二元以及杜长大三元猪4个群体的2,012头猪的17个分割肉性状和14个胴体性状。使用单倍型GWAS分析和基于基因型填充数据的GWAS分析分别鉴定到14个和112个与胴体分割性状极显著相关的QTLs。利用“中芯一号”芯片检测数据和基因型填充数据对这四个不同群体的分割肉性状和胴体性状进行全基因组选择研究。比较不同基因型数据、不同群体、以及不同预测模型对基因组预测准确性的影响。
图1 GWAS特性分析及GS没想到是比较
参考文献
Xie, L., Qin, J., Rao, L., Cui, D., Tang, X., Chen, L., Xiao, S., Zhang, Z., & Huang, L. (2023). Genetic dissection and genomic prediction for pork cuts and carcass morphology traits in pig. Journal of animal science and biotechnology, 14(1), 116.
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